L'Inserm entretient des relations privilégiées avec les Régions Pays de la Loire, Centre et Bretagne, mais aussi avec les municipalités et les conseils généraux. Ces relations sont souvent concrétisées par des conventions-cadres de coopération régionale qui déclinent, sous forme d'objectifs, les axes de partenariat que l'Inserm et une région souhaitent développer.
L'Inserm Grand Ouest bénéficie du soutien des collectivités, notamment dans le cadre du CPER - Contrat de Projets Etat Région.
Les Conseils régionaux de Bretagne, Centre-Val de Loire, Pays de la Loire
Les communautés d'agglomération de Nantes, Angers, Rennes, Tours, Brest